菲律宾ABG欧博基因测序事业部成立于2020年1月，通过综合使用高通量测序、Sanger测序、MLPA、飞行质谱、串联质谱、荧光RT-PCR等分子诊断技术，在心脑血管遗传病，包括心肌病、心律失常、大血管病、高血压及其他罕见病方面为客户提供基因检测、遗传咨询、专家报告解读等全方位服务及相关的科研服务。此外，针对当前新型冠状病毒（2019-nCoV）感染疫情，我们还提供病毒核酸检测科研服务。

2019年12月，湖北武汉爆发了不明原因肺炎。2020年1月7日中国科学家从武汉的患者中成功分离了一种新的冠状病毒。1月12日世界卫生组织正式将造成武汉肺炎疫情的新型冠状病毒命名为“2019新型冠状病毒（2019-nCoV）”。2019-nCoV引起的感染迅速升级，截止2月12日，全国确诊病例5万多例，疑似病例1万多例，确诊及疑似病例仍然在增加。

究竟是一种怎样的冠状病毒引起了如此严重的疫情，中国及国际的研究者们近期发表了11篇文章，详细论述了2019-nCoV基因序列，可能来源及侵入机体的受体等。

新型冠状病毒（2019-nCoV），即目前导致中国新型冠状病毒肺炎（novel coronavirus pneumonia，NCP）的病原体，属于β冠状病毒属的Sarbecovirus亚属。冠状病毒是一种包膜病毒，它拥有一个长度在26.2到31.7 kb之间的正单链RNA基因组。目前，关于2019-nCoV完整的基因组信息已可通过数据库查询，根据GenBank数据（由中国科学家上传），2019-nCoV基因组全长29903bp，共包含10个基因（Table 1，Figrue1）。 

Table 1. 2019-nCoV主要结构蛋白编码基因的位置及TRS信息

Figure 1. 2019-nCoV主要结构蛋白编码基因的位置

     目前，在以下的数据库可以找到2019-nCoV基因组序列数据，其中GenBank和RefSeq都属于美国国家医学图书馆生物技术信息中心。

1. GISAID (https://www.gisaid.org/)，是全球共享禽流感数据库，由多位医学科学家倡议建立，致力于改善流感数据的共享，目前收录53份2019-nCoV全基因组数据，但该数据库需要注册及审核。

2. GenBank(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/)，美国国家医学图书馆生物技术信息中心建立的基因序列数据库，截止2月12日收录53份2019-nCoV基因序列，其中，32份为全基因组序列（Table 2），该数据库免费。

3. RefSeq (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/NC_045512), 是美国国家医学图书馆生物技术信息中心的参考序列数据库，目前收录了1份2019-nCoV全基因组序列（Table 2）。该数据库无需注册。

Table 2. GenBank收录的2019-nCoV全基因组序列目录

目前，关于2019-nCoV基因组序列的研究共11篇（Table 3），其中5篇对患者肺泡灌洗液样本进行测序得到2019-nCoV基因组序列进行分析，4篇直接从数据库中下载基因组数据进行分析研究。

Table3.  2019-nCoV基因组序列研究

8篇文章通过比较2019-nCoV与SARS-CoV、MERS-CoV和bat-originCoVs(bat-CoVs)的序列，对2019-nCoV病毒的来源进行了分析。不同研究报道得出的2019-nCoV和其他冠状病毒同源性数据基本接近（Table 4，Figure 2）。2019-nCoV与人类SARS-CoV的同源性约为80%，与蝙蝠SARS like-CoV （bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZCX21）的同源性约为88%，与蝙蝠来源病毒（bat-CoVs）的同源性高达约96%。目前，根据流行病学和基因学研究证据，研究者推断，2019-nCoV很可能来自于蝙蝠，但存在中间宿主，需要进一步研究证实。

Table4. 2019-nCoV同源性研究

Figure2. 2019-nCoV基因组系统发育分析 

五、2019-nCoV如何侵入机体

研究表明，冠状病毒的S(spike)蛋白在功能上分为S1区（负责与受体结合）和S2区（负责细胞膜融合），是决定病毒入侵和传播的关键区域。通过系统分析2019-nCoV的受体结合域（receptor-binding domain, RBD）发现，与其他β冠状病毒一样，其受体结合域由核心和外部子域组成(Figure 3. A, B, C)。2019-nCoV的外部子域更接近于SARS-CoV。这一结果提示2019-nCoV也可能使用和SARS-CoV同样的受体——血管紧张素转换酶2 (ACE2)入侵细胞。对人类、中国马蹄蝠、果子狸、猪和小鼠中的表达和不表达ACE2的HeLa细胞进行病毒感染性的研究发现，2019-nCoV可以将除小鼠外的所有表达ACE2的细胞作为宿主，而对没有ACE2表达的细胞不可以。但是，2019-nCoV受体结合域与SARS-CoV受体结合域存在几个关键氨基酸的差异(包括Asn439、Asn501、Gln493、Gly485和Phe486)。结构分析表明，Gln493（对应SARS-CoV的479位置）能够与人ACE2产生良好的相互作用，而这些差异对2019-nCoV结合受体的影响仍需进一步研究。

因此，ACE2受体很可能是2019-nCoV病毒侵入机体的一种重要的途径。确切结论尚需要更多的研究证实。